Olá Renato.
"Precisa" ser um erro de customização.
Porque não é um erro durante a criação, caso contrário não criaria o billing.
Também é improvável que seja um erro da SAP, visto que é algo grave demais para não ter sido reportado.
Então, no:
Include LJ1BGF01
FORM fill_nf_lineit_interf
Você tem a rotina de cópia dos itens do billing para a nota.
Ali vai fazer verificações para itens que serão (ou não) copiados.
Seria possível em debug facilmente ver porque uma Ordem de 1 item não está indo para a Nota.
Começando pelo mais básico: verifica se o Item Category que você está utilizando está marcado como relevante pra NF na view J_1BSDIC.
abs
André